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如何從培養細胞中制備細胞核基質/中間纖維骨架結構?
發布時間: 2021-11-18 點擊次數: 861次材料與儀器
細胞
Tritron X-100 抽提緩沖液
電子顯微鏡步驟
1. 在 4℃ 用 PBS 洗細胞一次。
2. 在 4℃ 用含 0.5% Tritron X-100 的細胞骨架緩沖液抽提細胞 3 到 5 分鐘。直到消化步驟,每 107 個細胞最少要用 1 ml 緩沖液,以后減半。
3. 在 4℃ 用抽提緩沖液抽提細胞 3~5 分鐘。這一步去除組蛋白 H1 和除中間纖維蛋白之外的細胞骨架蛋白。另外,這一步也可在 DNA 酶消化步驟(第 4 步)之后作,這樣也不會引起超微結構的變化。
抽提緩沖液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
250 mmol/L 硫酸銨
300 mmol/L 蔗糖
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EDTA
4. 在含 0.5% Triton X-100 的消化緩沖液中用無 RNA 酶的 DNA 酶消化以去除染色質 DNA 酶濃度為 200~400 單位/ml,32℃ 反應 30~50 分鐘。
含 0.5% Triton X-100 的消化緩沖液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
300 mmol/L 蔗糖
50 mmol/L NaCl
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EGTA
5. 用抽提緩沖液清洗樣品兩次,每次 5 分鐘。
6. (可選)樣品在 4℃ 用 2 mol/L NaCl 抽提 3~5 分鐘。這一步能使可能形成核基質核心的 10 nm 纖絲分支顯形(Jackson and Cook 1988; He et al, 1990)。在第 4 步中用 Hae Ⅲ 和 Pst Ⅰ(每種酶 400 單位/ml)代替 DNA 酶 Ⅰ 可以使核心纖絲保存的更好。
2 mol/L NaCl 緩沖液:
10 mmol/L PIPES,pH 6.8
300 mmol/L 蔗糖
2 mol/L NaCl
3 mmol/L MgCl2
1 mmol/L EGTA
7. 固定核基質以進行免疫熒光檢測或電子顯微鏡檢測。